健康科学与工程学院前身为医疗器械与食品学院，成立于2003年，学院下设（挂靠）医疗器械学院、食品学院、机器智能研究院、东方泛血管器械创新学院、骨科生物医学和器械创新研究院、“一带一路”医疗器械监管科学研究院等部门。学院现有教职工213人，其中专任教师155人（正高34人，副高70人），博士后19人，教辅岗9人，管理岗18人，辅导员12人。具有博士学位的教师数占专任教师的96%，其中包括国家杰青获得者、教育部长江学者特聘教授等国家级人才9人次，教育部新世纪优秀人才等省部级人才53人次。

学院具备完整的人才培养体系，涵盖本科生、硕士生、博士生、博士后、继续教育。学院建有“生物医学工程”“食品科学与工程”2个一级学科博士点；拥有“生物医学工程”“食品科学与工程”“生物工程”3个一级学科硕士点、“生物医学工程”“食品工程”“医学技术（医学）”3个专业学位硕士点；拥有“生物医学工程”“医学影像技术”“医学信息工程”“康复工程”“智能医学工程”“食品科学与工程”“食品质量与安全”“制药工程”“生物技术”9个本科专业；设有“生物医学工程”“食品科学与工程”2个博士后科研流动站。在校生3055人，其中本科生1098人，硕士生1705人，博士生252人。

学院拥有完善的教学和科研平台。2006年获批上海市地方高校的第一个教育部工程研究中心--“现代微创医疗器械及技术”，2013年获批国家人社部第三批“国家级专业技术人员继续教育基地”，2015年获批上海市工程技术研究中心--“康复器械工程技术研究中心”，2016年获批上海市工程技术研究中心—“上海食品微生物工程技术研究中心”、国家民政部重点实验室—“神经功能信息与康复工程重点实验室”，2018年获批“上海市医疗器械工程实验教学示范中心”“上海市低温生物医学技术服务平台”“上海介入医疗器械工程技术研究中心”，2019年获批“上海食品快速检测工程技术研究中心”，2021年获批“国家粮食产业（城市粮油保障）技术创新中心”“上海市肿瘤能量治疗技术与器械协同创新中心”。

作为首批“全国党建工作标杆院系”，健康科学与工程学院坚持“一手建强基层组织，一手抓实创新发展”，精心打造“校企医监研”5+X党建联建平台，构建起大健康行业党建联盟矩阵，将事业发展融入行业、融入地区，推动学院人才培养、科学研究、社会服务等各方面工作创新发展。深入推进三全育人综合改革，落实立德树人根本任务。学院入选上海市课程思政领航学院，获评“上海市教卫工作党委系统先进基层党组织”，涌现出“全国党建工作样板支部”“全国高校百名研究生党员标兵”“上海市党支部建设示范点”等先进典型。

学院坚持“面向人民生命健康”，积极开展大健康领域前沿科学研究，科技创新能力与产业服务水平全面提升，近年来学院承担了100多项国家各类重要科研项目，获批经费超过1亿元；获得省部级以上科技奖励十余项，其中主持获得上海市科学技术奖技术发明奖一等奖1项、科技进步奖一等奖1项；发表SCI收录论文600余篇，授权发明专利近200项；完成横向科研成果转化200多项，创造经济效益超百亿元。

学院立足上海，服务全国，放眼世界，大力推进国际交流与合作，与美国、英国、德国、加拿大、日本、澳大利亚、爱尔兰等国的高校及科研机构建立了稳定的交流与合作关系。学院与蒙古高校联合开展了2+2国际合作人才培养项目，为蒙古培养了大量医疗器械人才。学院每年邀请百余人次国内外知名学者进行学术交流和合作研究。