2008.7—2011.4，中国科学院，上海生命科学研究院，植物生理生态研究所合成生物学国家重点实验室，助理研究员

2011.9—2014.8，光明乳业股份有限公司，乳业技术研究院，项目主管

2019.4—2022.6，上海理工大学，医疗器械与食品学院，讲师

2022.7- 至今，上海理工大学，健康科学与工程学院，副教授

2008.7—2011.4，中国科学院，上海生命科学研究院，植物生理生态研究所合成生物学国家重点实验室，助理研究员

2011.9—2014.8，光明乳业股份有限公司，乳业技术研究院，项目主管

2019.4—2022.6，上海理工大学，医疗器械与食品学院，讲师

2022.7- 至今，上海理工大学，健康科学与工程学院，副教授

2001.9—2005.6，南京师范大学，食品科学与工程系，学士

2005.9—2008.6，南京师范大学，微生物系，硕士

2014.9—2018.6，上海理工大学，生物医学工程系，博士

2017.3—2019.3，加拿大农业与农业食品部圭尔夫研究发展中心，食品科学，联合培养博士

1、乳酸菌高效基因编辑工具的构建

2、功能性乳酸菌的选育和机制解析

3、乳酸菌高密度发酵调控

4、乳酸菌合成生物学

【主持】

[1]国家自然科学基金青年项目：嗜热链球菌碳代谢调控高密度培养的机制研究（32101928），2022.01-2024.12 

[2]国家自然科学基金面上项目：肠道内源性乳杆菌CRISPR递送系统构建及其靶向调控研究，（32472316），2025.01-2028.12

[3]国家自然科学基金联合项目：基于基因组大数据和基因编辑乳酸菌益生机制的解析（U22A20540)，2023.01-2026.12

[4]国家自然科学基金联合项目：鄱阳湖流域药食同源植物活性多糖结构有序性与生物合成机制（U24A20467），2025.01-2028.12

[5]十四五重点研发项目子课题：益生菌食品制造产品质量安全控制追溯和定量关键技术及应用——基于功能基因的益生菌挖掘技术（2024YFD2100902)，2024.12-2027.11

[6]十四五重点研发项目子课题：药食同源作物和微生物食品加工关键技术及应用示范——药食同源作物和微生物中活性物质的生物利用度及其影响规律研究（2024YFD2100702），2024.12-2027.11

[7]上海市农业科技创新项目：奶酪发酵剂选育及产品开发关键技术研究与产业化示范（沪农科I2025002），2025.09-2028.08

8]中国食品科学技术学会青年基金：嗜热链球菌基因组规模代谢网络调控高密度培养策略研究（2023-Y03），2024.01-2024.12

【参与】

[1]国家自然科学基金青年项目（A类）：益生乳酸菌（32025029），2021.01-2025.12                  [2]上海市教委科研创新计划项目：多组学研究益生乳酸菌高活性制备机制及关键技术（2101070007E00120），2025.09-2028.08                                

【授权专利】

[1] 一种CRISPR-Cas9质粒及其构建方法与应用，发明专利，中国，ZL202211044839.6，2025年8月29日

[2] 一种清除双歧杆菌抗性质粒的基因编辑工具及其应用方法，发明专利，中国，ZL202211013044.9，2025年8月29日

【代表性论文】

[1] Song, X.; Li, Y. L.; Xia, Y. J.; Wang, G. Q.; Xiong, Z. Q.; Yang, Y.; Ai, L. Z*. Phage Tyrosine Integrase-Mediated Multi-Sites Genome Engineering in Lacticaseibacillus Casei. Food Biosci 2024, 58, 103694.

[2] Song, X.; Liu, L.; Liu, X. X.; Xiong, Z. Q.; Xie, C. L.; Wang, S. J.; Ai, L. Z*. Single-Plasmid Systems Based on CRISPR-Cas9 for Gene Editing in Lactococcus Lactis. J. Dairy Sci 2021, 104 (10), 10576–10585.

[3] Song, X.#; Huang, H.#; Xiong, Z. Q.; Ai, L. Z.; Yang, S*. CRISPR-Cas9D10A Nickase-Assisted Genome Editing in Lactobacillus Casei. Appl Environ Microbiol 2017, 83 (22), e01259-17.

[4] Wang, H.; Ai, L. Z.; Xia, Y. J.; Wang, G. Q.; Xiong, Z. Q.; Song, X*. Software-Based Screening for Efficient sgRNAs in Lactococcus Lactis. J Sci Food Agric 2024, 104 (2), 1200–1206.

[5] Song, X.#; Zhang, X. Y.#; Xiong, Z. Q.; Xia, Y. J.; Wu, Y.; Ai, L. Z.; Xu, H.; Tian, Y. J.; Yang, Y. J.; Wang, G. Q*. Characterization of Endogenous Constitutive Promoters from Lactobacillus Salivarius for Finely-Tuning Gene Expression. Food Biosci 2022, 50, 101980.

[6] Song, X.; Huang, H.; Xiong, Z. Q.; Xia, Y. J.; Wang, G. Q.; Yin, B. X; Ai, L. Z*. Characterization of a Cryptic Plasmid Isolated from Lactobacillus Casei CP002616 and Construction of Shuttle Vectors Based on Its Replicon. J. Dairy Sci 2018, 101 (4), 2875–2886.

[7] Song, X.; Xiong, Z. Q.; Kong, L. H.; Wang, G. Q.; Ai, L. Z*. Relationship Between Putative Eps Genes and Production of Exopolysaccharide in Lactobacillus Casei LC2W. Front Microbiol 2018, 9, 1882.

[8] Song, X.; Hou, C. J.; Yang, Y.; Ai, L. Z.; Xia, Y. J.; Wang, G. Q.; Yi, H. X.; Xiong, Z. Q*. Effects of Different Carbon Sources on Metabolic Profiles of Carbohydrates in Streptococcus Thermophilus During Fermentation. J Sci Food Agric 2022, 102 (11), 4820–4829.

[9] Song, X.; Li, F. J.; Zhang, M. S.; Xia, Y. J.; Ai, L. Z.; Wang, G. Q*. Effect of D-Ala-Ended Peptidoglycan Precursors on the Immune Regulation of Lactobacillus Plantarum Strains. Front Immunol 2022, 12, 825825.

[10] Wang, G. Q. #; Yu, H. N. #; Feng, X.; Tang, H. Y.; Xiong, Z. Q.; Xia, Y. J.; Ai, L. Z.; Song, X*. Specific Bile Salt Hydrolase Genes in Lactobacillus Plantarum AR113 and Relationship with Bile Salt Resistance. LWT 2021, 145, 111208.