1. 2007-7至今, 上海理工大学, 健康科学与工程学院, 副教授

2. 2016-11至2017-11, 杜兰大学, 公共医学与热带医学学院, 访问学者

3. 2008-11至2009-11, 密苏里大学堪萨斯分校, 医学院生物信息系, 访问学者

1. 2007-7至今, 上海理工大学, 健康科学与工程学院, 副教授

2. 2016-11至2017-11, 杜兰大学, 公共医学与热带医学学院, 访问学者

3. 2008-11至2009-11, 密苏里大学堪萨斯分校, 医学院生物信息系, 访问学者

1. 2002-09 至 2007-07, 中国科学技术大学, 计算机应用技术, 博士

2. 1997-09 至 2002-08, 中国科学技术大学, 计算机科学与技术, 学士

1. 智能医学信息处理

2. 生物信息学

【主持】

[1] 面向测序技术的外显子组拷贝数变异检测算法研究与应用，国家自然科学基金

[2] 基于超声影像早筛剖宫产切口憩室智能化分析仪的研发，中国福利会国际和平妇幼保健院

[3] 儿童头颅扫描仪的研发，上海交通大学附属新华医院

[4] 全自动微生物鉴定功能验证系统，上海复星长征医学科学有限公司

[1] Lin, Y., et al., Comparative studies of de novo assembly tools for next-generation sequencing technologies. Bioinformatics, 2011. 27(15): p. 2031-2037.(ESI index, cited 136)

[2] Benyamin B,.. Y. Lin,..Fan D. Cross-ethnic meta-analysis identifies association of the GPX3-TNIP1 locus with amyotrophic lateral sclerosis. Nat Commun. 2017, Sep 20; 8(1):611. doi: 10.1038/s41467-017-00471-1.

[3] 许珉瑞,张斯文,林勇,等. 基于大模型的MHC II抗原肽-T细胞受体结合预测[J].生物医学工程学杂志, 2024, 41(6):1243-1249.

[4] Zhang Y , Jian X , Lin Y.*,et al.iTCep: a deep learning framework for identification of T cell epitopes by harnessing fusion features[J].Frontiers in Genetics, 2023.DOI:10.3389/fgene.2023.1141535.

[5]  高媛,鲁曼曼,林勇,等.基于双模块卷积神经网络的TCR-多肽结合位点预测.软件工程, 2024, 27(5):51-55.

[6]  M.M. Lu, Lin Y.* et al. dbPepNeo2.0: A Database for Human Tumor Neoantigen Peptides From Mass Spectrometry and TCR Recognition, Frontiers in Immunology, 2022. 4, DOI: 10.3389/fimmu.2022.855976

[7] 赵清一,林勇.基于迁移学习和支持向量机的乳腺癌分子分型预测[J].中国医学物理学杂志, 2022, 39(5):635-639.

[8] L.F.Xu, Lin Y.* et al. Construction and Validation of an Immune Cell Signature Score to Evaluate Prognosis and Therapeutic Efficacy in Hepatocellular Carcinoma, Frontiers in Genetics,2021.9, DOI: 10.3389/fgene.2021.741226.

[9] 杨晨雨等. 基于多组学数据的肿瘤药物敏感性预测. 生物工程学报 38.6(2022):2201-2212.