健康科学与工程学院前身为医疗器械与食品学院，成立于2003年，学院下设（挂靠）医疗器械学院、食品学院、机器智能研究院、“一带一路”医疗器械监管科学研究院、东方泛血管器械创新学院、骨科生物医学和器械创新研究院等部门。学院现有一支200多人的专业师资队伍，正高32人，副高62人，具有博士学位的教师数占专任教师的96%，其中包括国家杰青获得者、新世纪百千万人才工程等国家级人才9人次，教育部新世纪优秀人才等省部级人才53多人次。

学院具备完整的人才培养体系，涵盖本科生、硕士生、博士生、博士后、继续教育。学院建有“生物医学工程”、“食品科学与工程”2个一级学科博士点；拥有“生物医学工程”、“食品科学与工程”2个一级学科硕士点、“电子信息”、“食品工程”、“医学技术”3个专业学位硕士点；拥有 “生物医学工程”、“医学影像技术”、“医学信息工程”、“康复工程”、“制药工程”、“智能医学工程”、“食品科学与工程”、“食品质量与安全”8个本科专业；设有“生物医学工程”、“食品科学与工程”2个博士后科研流动站。在校生近2800人，其中本科生1100余人，硕士生1500余人，博士生210余人，在站博士后10余人。

学院拥有完善的教学和科研平台，设备先进。2006年获批上海市地方高校的第一个教育部工程研究中心--“现代微创医疗器械及技术”，2013年获批国家人社部第三批“国家级专业技术人员继续教育基地”，2015年获批上海市工程技术研究中心--“康复器械工程技术研究中心”，2016年获批上海市工程技术研究中心—“上海食品微生物工程技术研究中心”、国家民政部重点实验室—“神经功能信息与康复工程重点实验室”，2018年获批“上海市医疗器械工程实验教学示范中心”、“上海市低温生物医学技术服务平台”、“上海介入医疗器械工程技术研究中心”，2019年获批“上海食品快速检测工程技术研究中心”，2021年获批“国家粮食产业（城市粮油保障）技术创新中心”、“上海市肿瘤能量治疗技术与器械协同创新中心”。

作为首批“全国党建工作标杆院系”，学院坚持“一手建强基层组织，一手抓实创新发展”，精心打造“校企医监研+社区”5+X党建联建平台，并不断拓展延伸，主动将事业发展融入行业、融入地区。深入推进三全育人综合改革，落实立德树人根本任务。学院入选上海市课程思政领航学院，荣获“上海市教卫工作党委系统先进基层党组织”等荣誉称号。

学院坚持“面向人民生命健康”，积极开展大健康领域前沿科学研究，在上海市重点学科、一流学科、高原学科等的持续支持下，科技创新能力与产业服务水平全面提升，近年来学院承担了100多项国家各类重要科研项目，获批经费超过1亿元；获得省部级以上科技奖励十余项，其中主持获得上海市技术发明一等奖1项、科技进步奖一等奖1项；发表SCI收录论文600余篇，授权发明专利近200项；完成横向科研成果转化200多项，创造经济效益超百亿元。

学院立足上海，服务全国，放眼世界，大力推进国际交流与合作，与美国、英国、德国、加拿大、日本、澳大利亚、爱尔兰等国的高校及科研机构建立了稳定的交流与合作关系，并且学院与蒙古高校联合开展了2+2国际合作人才培养项目，为蒙古培养了大量医疗器械人才，学院每年邀请百余人次国内外知名学者进行学术交流和合作研究。