【机构设置】

医疗器械学院

食品学院

机器智能研究院（挂靠）

“一带一路”医疗器械监管科学研究院（挂靠）

东方泛血管器械创新学院（挂靠）

骨科生物医学和器械创新研究院（挂靠）

生物医学工程系（研究所）

医学影像技术系（研究所）

医学信息工程系（研究所）

康复工程与技术系（研究所）

食品科学与工程系（研究所）

食品质量与安全系（研究所）

制药工程系（研究所）

生物系统热科学研究所

实验中心

医学基础教研室

党政综合办公室

卓越工程教育办公室

学生工作办公室

【教学科研平台】

教育部现代微创医疗器械及技术工程研究中心（2006年）

分子免疫诊断试剂国家工程实验室（2008年）

国家人社部国家专业技术人员继续教育基地（2013年）

上海康复器械工程技术研究中心（2015年）

上海食品微生物工程技术研究中心（2016年）

民政部神经功能信息与康复工程重点实验室（2016年）

上海介入医疗器械工程技术研究中心（2018年）

上海市低温生物医学技术服务平台（2018年）

上海市医疗器械工程实验教学示范中心（2018年）

上海食品快速检测工程技术研究中心（2019年）

国家粮食产业技术创新中心（2021年）

上海市肿瘤能量治疗技术与器械协同创新中心（2021年）